Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms