Protein–RNA interactions for Protein: Q8N841

TTLL6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL6Q8N841 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL6Q8N841 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms