Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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