Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PLD3Q8IV08 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PLD3Q8IV08 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLD3Q8IV08 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLD3Q8IV08 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLD3Q8IV08 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms