Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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RAB11FIP4Q86YS3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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RAB11FIP4Q86YS3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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RAB11FIP4Q86YS3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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RAB11FIP4Q86YS3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
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RAB11FIP4Q86YS3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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RAB11FIP4Q86YS3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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RAB11FIP4Q86YS3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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RAB11FIP4Q86YS3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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RAB11FIP4Q86YS3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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RAB11FIP4Q86YS3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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RAB11FIP4Q86YS3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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RAB11FIP4Q86YS3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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