Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP13Q86W25 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms