Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R42Q7Z4L9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms