Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms