Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q71RC1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q71RC1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q71RC1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q71RC1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q71RC1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q71RC1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q71RC1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q71RC1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q71RC1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q71RC1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q71RC1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q71RC1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q71RC1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q71RC1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q71RC1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q71RC1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q71RC1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q71RC1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q71RC1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q71RC1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q71RC1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q71RC1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q71RC1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q71RC1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms