Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
XIRP1Q702N8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP1Q702N8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms