Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms