Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms