Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms