Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms