Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms