Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms