Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms