Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms