Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms