Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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