Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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