Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms