Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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