Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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