Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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