Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
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PTPRKQ15262 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
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PTPRKQ15262 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
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PTPRKQ15262 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
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PTPRKQ15262 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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PTPRKQ15262 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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PTPRKQ15262 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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PTPRKQ15262 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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PTPRKQ15262 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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PTPRKQ15262 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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PTPRKQ15262 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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PTPRKQ15262 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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PTPRKQ15262 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
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