Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PDK3Q15120 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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