Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCOLCEQ15113 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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