Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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BRD3Q15059 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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BRD3Q15059 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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BRD3Q15059 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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BRD3Q15059 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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BRD3Q15059 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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BRD3Q15059 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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