Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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