Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
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CHD4Q14839 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
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CHD4Q14839 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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CHD4Q14839 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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CHD4Q14839 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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CHD4Q14839 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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