Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC3Q14574 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms