Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSHL1Q14406 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms