Protein–RNA interactions for Protein: Q14203

DCTN1, Dynactin subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN1Q14203 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCTN1Q14203 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms