Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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COL9A2Q14055 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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COL9A2Q14055 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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COL9A2Q14055 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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COL9A2Q14055 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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COL9A2Q14055 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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COL9A2Q14055 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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COL9A2Q14055 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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COL9A2Q14055 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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COL9A2Q14055 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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