Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms