Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBFBQ13951 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms