Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX2Q13950 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms