Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCINQ13939 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCINQ13939 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms