Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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SNTB1Q13884 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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SNTB1Q13884 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SNTB1Q13884 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SNTB1Q13884 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SNTB1Q13884 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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SNTB1Q13884 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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SNTB1Q13884 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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