Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms