Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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PEX6Q13608 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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PEX6Q13608 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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PEX6Q13608 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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