Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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