Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RESTQ13127 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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RESTQ13127 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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RESTQ13127 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RESTQ13127 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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RESTQ13127 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RESTQ13127 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RESTQ13127 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RESTQ13127 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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RESTQ13127 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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RESTQ13127 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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RESTQ13127 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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RESTQ13127 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RESTQ13127 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RESTQ13127 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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RESTQ13127 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RESTQ13127 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RESTQ13127 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RESTQ13127 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RESTQ13127 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RESTQ13127 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RESTQ13127 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RESTQ13127 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RESTQ13127 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms