Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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