Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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