Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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PTPRJQ12913 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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PTPRJQ12913 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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PTPRJQ12913 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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PTPRJQ12913 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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PTPRJQ12913 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTPRJQ12913 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTPRJQ12913 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTPRJQ12913 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTPRJQ12913 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTPRJQ12913 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTPRJQ12913 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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