Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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