Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP160Q12769 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
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