Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms